В 1998 году Арктический совет выступил с инициативой о создании Университета Арктики, который был официально открыт в 2001 году в Рованиеми (Финляндия). Международный секретариат Университета Арктики с момента создания работает в Лапландском университете в Рованиеми. Поскольку Университет Арктики - децентрализованная организация, финансовыми и юридическими делами в основном занимаются принимающие университеты. С целью укрепления позиций Университета Арктики в том, что касается заключения договоров, фандрайзинга и обязательств, и после одобрения руководящими органами Университет Арктики был официально зарегистрирован как некоммерческая ассоциация "UArctic ry" в соответствии с законодательством Финляндии в ноябре 2019 года.